羊多头蚴病的治疗方法较为复杂，需要根据虫体所在的部位实施外科手术，通过开口先吸出囊中液体使囊体缩小，然后完整摘除虫体。药物治疗可使用吡喹酮，对病羊进行每天50毫克/公斤的剂量，连续使用5天，或按70毫克/公斤连续使用3天。由于此病可能影响羊的脑部，因此积极预防至关重要。应定期对狗进行驱虫，使用硫双氯酚0.1克/公斤体重，或氢溴酸槟榔素1.5至2毫克/公斤，包裹在食物中喂服。在驱虫期间，应将狗拴养一周，并将其粪便深埋或烧毁。注意保护饲草和饮水，防止犬类躺在草堆上造成污染。防治羊多头蚴病的措施包括对牧羊犬定期驱虫，并进行粪便的无害化处理。对于野犬、狼、狐等终末宿主应采取捕杀措施。在疫情流行区，应根据临床症状、病史和头部触诊综合判断，若脑前部寄生于表面的虫体可进行外科手术摘除。同时，可使用吡喹酮或丙硫咪唑进行治疗。