牛东毕吸虫病在流行地区依据症状和流行特点，结合粪检发现虫卵即可确诊。因东毕吸虫排卵数量少，故进行粪检时应采集多量粪便。必要时可进行尸检，在肠系膜静脉内或肝脏内发现大量虫体亦可确诊。
诊断是1。粪检用沉淀法检查虫卵，其中有长楠圆形虫卵和卵圆形虫卵两种。用孵化法检查毛蚴，毛蚴呈灰白色，针尖大，云雾状，具有趋光性，在水中直线运动。2。镜检发现一种虫卵呈柳叶状;另一种长卵圆形，一端呈睡状物，另一端有刺状突起。
