淡水小龙虾对有机或无机化学物质非常敏感，超限可能引起中毒。病因能引起淡水小龙虾中毒的化学物质比较多，来源主要有水池中有机物腐烂分解、工业污水排放进入虾池、农药和其他药物进入虾池等。
池中残饵、排泄物、水生植物和动物尸体等腐烂，微生物分解产生大量氨、硫化氢、亚硝酸盐等物质；工业污水中含有汞、铜、镉、锌、铅、铬等重金属元素、石油和石油制品，以及其他有毒性的化学成品，都会使虾类中毒，造成生长缓慢甚至死亡。另外，小龙虾对许多杀虫剂特别敏感，这些农药除直接杀伤虾体外，还能使虾发生肝胰腺病变，引起慢性死亡。
病症临床观察可见两类症状：一类是慢性发病，出现呼吸困难，摄食减少，以及零星死亡，随着病情的发展死亡率增加；另一类是急性发病，小龙虾出现大批死亡，尸体上浮或下沉。在尸体剖检时，可见鳃丝组织坏死变黑。
防治措施：
1.详细调查虾池周围的水源情况；
2.立即将存活虾转移到经清池消毒的新池中养殖，并增加池塘溶氧量；
3.清理水源和水环境，根除污染源；
4.新建养殖池必须进行浸泡后再使用。