亚急性和慢性型主要以损害生殖系统为特征。病初体温有不同程度升高，眼结膜潮红、浮肿，有的泛黄，有的下颌、头部、颈部和全身水肿。
母猪一般无明显的临诊症状，有时可表现出发热、无乳。但妊娠不足4～5周的母猪，受到钩端螺旋体感染后4～7天可发生流产和死产，流产率可达20%～70%。怀孕后期的母猪感染后可产弱仔，仔猪不能站立，不会吸乳，1～2天死亡。
病犬口粘膜可见有不规则的出血斑和黄疸；眼部可见有结膜炎症状，眼角有粘液性分泌物。同时可见咳嗽气喘及呼吸困难。患犬有的表现烦渴多尿等症状，得过亚急性感染的犬大约在2-3周后恢复。