自1993年中国对虾发生大面积暴发病以来，科技人员与养殖业者经过多年研究与试验，探索了许多有效的防治措施，如封闭式养殖、鱼虾贝藻立体式混养等模式，加强苗种病害监测，开展SPF虾苗培育，开发微生物制剂与免疫添加剂，并引进南美白对虾新品种，极大地提高了对虾产量。然而，病害问题仍是制约养殖发展的最大障碍。2004年，浙江省舟山、绍兴、萧山、嘉兴等地南美白对虾暴发病害，造成上亿元经济损失。经过两年的实践，我们课题组采用不同于传统的病害防治技术，不仅发病率低（仅为10%）、发病时间推迟，还取得亩产500千克、亩均效益4000元以上，部分高产虾塘亩均产量800千克、亩均效益9000元的优异成绩。
一、突破现有养虾模式，肥水养虾
南美白对虾的养殖模式经过发展，以高效消毒剂结合微生态制剂为主要方向，强调水体透明度保持在30～40厘米，氨氮、亚硝酸氮含量在0.1毫克/升以下。在此思路指导下，各类微生态制剂得以广泛应用，但养殖户反映效果不明显。目前，水产养殖中微生物的使用仍非常有限，难以获得业者认同。养虾水体不同于景观水体，需维持一定的藻相与菌相，片面强调水体降氮（反硝化脱氮）使养殖户不敢施肥，最终导致水体缺氮使藻相与菌相崩溃，引发疾病暴发。
尽管养殖户普遍了解早期肥水的重要性，却忽视了中期施肥。南美白对虾随着养殖时间的延长，水体有机物增多，氨氮等指标上升是必然的。实践证明，对虾对肥水有较强适应性。南美白对虾养殖周期一般需80天以上，养殖过程中水质变化不可避免，气候变化或不当药物使用均会导致藻类、有益菌死亡，此时需维护藻相与菌相。虽然通过添加外源性微生物制剂分解有机物可产生氨氮、硝态氮以满足藻类需求，但微生态制剂的使用仍有许多局限。
我们在试验中，早期使用发酵有机肥或混合化肥肥水；中期根据藻相变化，使用进口复合肥调水，全程以添加新水为主，未采取其他措施，也未发生虾病。进口复合肥含氮、磷、钾，其氮肥为硝态氮，不易被底泥吸附，可直接为藻类利用，一般使用两三天后即可恢复至原水色。亚硝酸氮在氮循环中被硝化菌氧化为硝酸氮，为藻类提供养分。但硝化菌繁殖速度慢，且虾池中常因反硝化脱氮导致水体氮源缺乏，藻类死亡破坏微生态平衡。藻相变化可能因气候变化或投饵过多引起，台风或长时间阴雨天气导致藻类生长受阻，溶氧降低，抑制好氧菌生长，微生态平衡被破坏。
二、尽量少用或不用化学消毒药物
南美白对虾器官构造及机能简单，免疫系统发育不完善，外界应激易降低其抗病力。南美白对虾的白斑、桃拉综合症高发阶段，水体继发性感染的弧菌等维持较高水平，但此时使用消毒剂会加速病虾死亡，原因是消毒剂破坏水体微藻、微生物菌群，同时对虾产生强烈应激，加剧病情恶化。
实践表明，对于携带病毒的对虾，维持稳定的水质环境能有效避免病害发生或减轻病情。相反，消毒剂如二溴海因、季铵盐碘等，无论是定期消毒还是治疗，对病毒性虾病既无预防效果，也无法控制病情，反而作为胁迫因子破坏虾池水质微生态平衡，进一步降低对虾免疫力。因此，养虾过程中应改变用药预防病害的观念，即使使用药物，也应及时通过施肥调整微生态平衡，最大限度恢复原有水质环境。
三、实施科学投饲
不合理投饲造成水质败坏是引发病害的主要原因之一。从经济效益与生态效益出发科学养虾至关重要。盲目大量放养虾苗、投饲不仅提高单位成本、降低效益、增加风险，还因饲料系数高导致水质污染，破坏生态环境。我们试验发现，南美白对虾高产池塘的饲料系数均在1.3以下，甚至达到0.9。关键措施包括：
1.早期肥水下苗，推迟引食：虾苗放养前通过培育天然饵料生物，一周至半个月后用1料少量引食，培育的虾苗健壮、生长快，可节省部分饲料。
2.中期控制投饲：7～8厘米后的虾吃食旺盛，需确保饲料在1小时内吃完，结合饲料台与池底检查，关注空胃率。饲料台上饲料吃得快可能是池底水质问题的信号。养殖高峰期投饲量控制在每万尾虾苗1.5～2千克，高密度池塘在虾规格60～70头时可起捕部分，缓解投饲压力。
3.虾顿料处理：虾顿料通常为水质问题，通过减料、泼洒沸石粉或少量换水即可好转。