石斑瓣体虫的虫体寄生在石斑鱼的体表、鳃和鳍上。从症状上看，很像小瓜虫病。池塘养殖的部分病鱼浮于水面，游泳缓慢，呼吸困难，不摄食，皮肤、鳃和鳍上的粘液分泌增多；体表布满白点，出现形状不规则的白斑，病情严重的，白斑扩大连成一片；病死的鱼胸鳍向前方伸直，几乎贴近于鳃盖下沿。因此，该病又俗称"白斑病"。发病几天后就出现死亡，病鱼死亡后通常会沉入塘底。
最初鱼体两侧出现指印状红色或淡红色斑块，也可发生在头部和尾部，病灶部位稍有隆起。随着病情恶化，病灶转为白色斑块，病灶部位鳞片逐渐松弛易脱落，鳞片脱落后裸露出更为清晰白斑。病鱼无食欲，死亡率高达90％。