牛只本身是屠宰检疫的重要对象。牛只在屠宰前需要接受检疫人员的检查，以确保其身体健康和无传染病。常见的检疫项目包括对牛只的体温、呼吸、精神状态等的观察，以及对皮肤、眼睛、耳朵、鼻子等的检查。如果发现牛只有发热、呼吸困难、肌肉萎缩等异常情况，将进行进一步的检测和诊断，以确定是否存在传染病风险。
牛舍也是屠宰检疫的重要环节。牛舍应当保持清洁、干燥，并配备适当的排泄物处理设施。屠宰前，牛舍应进行消毒处理，以杀灭可能存在的病原体和细菌。此外，牛舍的通风和空气流通也需要得到保障，以防止疫情传播。
屠宰场是屠宰检疫的最终环节。屠宰场应具备合格的卫生设施和检疫设备，确保屠宰过程的卫生和安全。在屠宰过程中，检疫人员会对屠宰场的环境、设备以及工作人员进行监督和检查。他们会检验屠宰场的卫生条件，确保屠宰过程中不会对牛只和食品带来污染。