犊牛球虫病的起始症状通常包括发热和精神不振，患牛可能表现出食欲不振、口水增多、倦怠、无精打采和离群独处。随着病情的发展，眼结膜会出现充血和肿胀，眼球可能有浓稠分泌物，呼吸急促并伴有咳嗽，体温持续升高。消化系统方面，患牛可能出现腹泻、腹胀，粪便稀烂或水样，有时伴有血便，食欲不振和消瘦导致体重迅速下降。晚期症状可能包括神经症状如抽搐、肌肉痉挛和瘫痪，以及异常行为如头部后仰、圆转和乏力，此时生存率通常较低。
