牦牛长期饲喂冰冻饲料会导致其营养价值下降。冰冻饲料在长时间的低温保存过程中，其中的营养成分会发生一定程度的损失。例如，维生素C是牦牛所需的重要营养素之一，但在冷冻过程中，维生素C的含量会明显下降。此外，冰冻饲料中的蛋白质和碳水化合物也会受到一定程度的破坏，导致牦牛无法获得足够的营养。
长期饲喂冰冻饲料可能引发消化问题。牦牛的消化系统相对较为敏感，对于难以消化的冰冻饲料，容易引起消化不良、胃痛等问题。冰冻饲料的质地较硬，需要更多的时间和能量来消化，从而增加了牦牛的消化负担。长期饲喂冰冻饲料还可能导致牦牛的食欲不振，进一步影响其健康状态。
长期饲喂冰冻饲料还可能导致牦牛的免疫功能下降。冰冻饲料中的营养成分损失和消化问题可能降低牦牛的抗病能力，使其更容易受到疾病的侵袭。此外，冰冻饲料中的微生物活性也会受到抑制，导致牦牛免疫系统的正常功能受到影响。长期饲喂冰冻饲料可能会增加牦牛患病的风险，严重影响其生长和生产能力。