合理的药物治疗是治疗牛犊病毒性腹泻的重要手段之一。常用的药物包括抗病毒药物、抗菌药物和解热药物等。抗病毒药物可用于直接抑制病毒的复制和繁殖，减轻病毒对牛只的损害。抗菌药物主要用于预防和治疗继发性细菌感染，以减少病情的进一步恶化。解热药物则可帮助降低牛只的体温，减轻发热症状。
加强牛只的营养支持也是重要的治疗措施之一。由于牛犊病毒性腹泻会导致牛只食欲不振和腹泻，从而引起营养不良和脱水等问题，因此，给予适当的营养支持十分必要。可通过提供易消化的饲料和补充必要的维生素、矿物质等，维持牛只的营养平衡，促进康复。
此外，加强牛只的环境管理和卫生控制也是治疗牛犊病毒性腹泻的重要环节。保持牛舍的清洁和干燥，避免不洁水源和粪便的污染，可有效降低病原菌的传播和感染的风险。定期清理和消毒牛舍、饮水设施等，有助于减少病毒的存活和传播。