病菌以分生孢子或菌核随病株残余组织遗留在田间越冬或越夏。在适宜条件下，菌核萌发产生菌丝体，继而形成分生孢子，通过气流、雨水传播，从气孔或伤口等侵入叶片，引起初侵染。病部产生的分生孢子借气流、雨水或农事操作传播，进行再侵染。
病菌以菌核或分生孢子在土壤中或病残体内越冬。借气流、雨水传播蔓延。每次收韭菜都会把病菌散落于土表，致新生叶染病。灰霉病的发生于温湿度的关系密切，湿度大利于发病。
