辣椒疫病从幼苗到结果均能发生，叶片和果实出现水渍状病斑是其典型症状。幼苗期发病多从茎基部开始，病部呈现水渍状软腐，病斑暗绿色，导致上部倒伏，最终猝倒或立枯死亡。定植后，叶部染病产生暗绿色病斑，叶片软腐脱落；茎部染病亦出现暗绿色病斑，引起软腐或茎枝倒折，湿度大时病部可见白霉；花蕾被害迅速变褐脱落；果实发病多从蒂部或果缝处开始，初为暗绿色水渍状不规则形病斑，迅速扩展至整个果实，呈灰绿色，果肉软腐，病果失水干缩挂在枝上呈暗褐色僵果。辣椒疫病对产量和品质影响极大，严重时减产50%以上。成株期发病以根、茎受害较多，根部受害呈褐色长形斑，病斑长3～5厘米可围茎，病健交界明显，病斑凹陷或稍缢缩，最终引起整株枯萎死亡。