白绢病主要侵染果树近地面的茎干部位。发病初期，受害部位呈暗褐色，随后迅速软腐，并在病部表面形成密集的白色丝绢状菌丝体，同时产生大量油菜籽状的褐色小菌核。病菌分泌的水解酵素复合物和草酸等物质协同作用于植物组织，导致植株水分吸收受阻，下部叶片开始黄化。若病情严重，整株植物会迅速萎凋死亡。在拔出病株时，可见根部周围被白色菌丝束所缠绕，最终导致根组织腐烂。
