大蒜发病初期，可在中下部叶片发现少量梭形或棱形褪绿斑，病斑长约1-3厘米，逐渐变成橙黄色稍隆起（病菌的夏孢子堆），病斑四周有黄色晕圈。后期叶片和假茎发展，严重时叶片病斑密布、连片，全叶发黄，植株提前枯死。最后，在病部未破裂的夏孢子堆上形成长椭圆形的黑褐色疤斑，即病菌的冬孢子堆。大蒜锈病主要侵染叶片和假茎，病部初为梭形褪绿斑，后在表皮下现出圆形或椭圆形稍凸起的夏孢子堆，表皮破裂后散出橙黄色粉状物，即夏孢子，病斑四周具黄色晕圈，后病斑连片会使全叶枯黄。大蒜锈病的发病症状表现为麻叶、萎缩、发黄。除侵染大蒜外，还侵染洋葱、韭菜等。