菠菜幼苗期容易受到病虫草害的影响，常见病害有霜霉病、炭疽病、枯萎病和病毒病等。此外，菠菜是蚜虫的越冬场所，如不及时防治，将危害菠菜并传播疾病。应在菠菜停止生长前使用氧化乐果、溴氰菊醋、灭蚜松等农药进行防治。同时，立风障不可过早，以免蚜虫聚集其上，为传播病毒病创造条件。
