防治西瓜最有效的方法是嫁接换根，利用高抗枯萎病的葫芦科作物如葫芦或新土佐作为砧木，嫁接西瓜品种。确保彻底断掉西瓜根，并在栽植时避免嫁接口与土壤接触，可以有效预防西瓜枯萎病的发生。此外，栽培措施包括实行轮作、培育无病健壮秧苗、科学栽培、改善环境，以及必要时进行药剂防治，都是控制该病的关键策略。
