根螨的成、若螨主要危害葱蒜类蔬菜的根部、假茎和鳞茎,导致须根脱落,鳞茎软化腐烂并发臭。受害植株地上部生长缓慢,叶鞘和叶片从外层开始腐烂,逐渐向内发展,最终整株枯黄死亡。在仓库内,根螨也会危害蒜头和洋葱头,造成缺刻和凹陷,严重时同样导致腐烂发臭。大蒜根螨尤其易发生在有机质丰富的酸性砂质土壤中。