辣椒软腐病属细菌性病害，高温高湿的天气容易发病。该病的发生与棉铃虫、烟青虫等钻蛀性害虫的消长关系密切，害虫严重的地方病害也重。在7-9月闷热多雨、高温高湿时最易发病。地势低洼、排水不良、过度密植、氮肥过多、通风不良、管理粗放、伤口多、大棚滴水处以及贮运期间温湿度高均利于发病。此外，使用退化品种、重茬种植地、土壤黏性重、田间湿度大、种植密度高、苗株长势弱、偏施氮肥、通风透光环境差的地块上，辣椒软腐病的发病率高、危害重。蚜虫、蓟马、粉虱、棉铃虫等刺吸口虫害多的种植地，会导致辣椒软腐病短期内爆发流行。