病菌在寄主地下或地面处的小菌核，借雨水或灌溉水传播，直接从根部或近地面处侵入，引起葱、蒜、韭菜等百合科蔬菜发病。大蒜白腐病的病原菌在地面越冬，借雨水或灌溉传播，直接从根部或近地面处侵入，引起发病，地温12.5℃左右适合白腐病原菌核的形成和菌丝生长。潜伏于蒜种上的菌丝很快显症，在蒜瓣表面形成黑色球形菌核。在大蒜幼苗返青期，浇水后植株抗病力弱，而5~20厘米土层地温高于7℃~8℃，正适合白腐病萌发，随流水不断形成再侵染，为害植株，造成田间大量死苗。立春后随着地温升高以及植株抗病力增强，田间危害减弱。