大蒜紫斑病的发生与湿度、光照等因素有关，因此种植大蒜时，应选择脱毒种蒜，并合理轮作，生长中增施氮肥，雨后及时排水。如果患病，使用百菌清或异菌脲进行喷施，隔7至10天喷一次，连续用药2至3次。预防方法包括施足基肥，加强田间管理，增强寄主抗病力，实行2年以上轮作，选用无病种子，必要时种子用40%甲醛300倍液浸3小时，浸后及时洗净。鳞茎可用40—45℃温水浸1.5小时消毒。发病初期可用化学农药进行防治，如3％多氧清水剂800倍液或78％科博可湿性粉剂500倍液、41.5％扑霉灵1500倍液、75％百菌清可湿性粉剂500～600倍液、50％异菌脲可湿性粉剂1500倍液，隔7-10天1次，连续防治3~4次，采收前7天停止用药。适时收获，低温贮藏，防止病害在贮藏期继续蔓延。窖温控制在0℃，相对湿度65％以下。