大蒜根腐病的防治方法包括：一是浸种消毒，二是轮作换茬，三是预防为主。可在发病初期每亩用灭菌成(50%氯溴异氰尿酸可湿性粉剂)30克、氨基酸类液肥如(金太龙或蒜田保护剂)200克加水30公斤喷雾或灌根，隔5天防治1次，连防2～3次。发病严重的植株和死亡植株应及时拔除带出田外，防止病害传染蔓延。大蒜根腐病要以预防为主，目前防治大蒜根腐病最简单，最有效的方法就是药剂拌种，可在大蒜播种前，每亩用41%唑醚·甲菌灵悬浮种衣剂150～450毫升，拌大蒜种子150公斤，将种衣剂均匀包裹在种子表面，可有效阻止病菌的侵入。大蒜适宜种植黑胶泥土壤，不适合沙质土壤，沙壤土最易得根腐病，哪怕是头一次种植。防治方法：对种子进行处理，使用嘧菌酯有效用量2.4克/100千克种子，每每按以上制剂量兑水15千克种子均匀拌种，进行种子处理防治。