首先选择优良品种，加强田间管理科学防治病虫害。当雌雄虫之比接近1∶1或成虫量突然增加时，为防治成虫适期，根据萝卜蝇具有舔吸糖醋液的特性进行诱杀。
1、农业防治。施用充分腐熟的有机肥，并做到均匀深施，以减少成虫产卵。在萝卜收获后，及时清理田园。
2、物理防治。在成虫盛发期，可在田间设置黄板诱杀成虫，并注意适时更换黄板。同时可在田间喷2.5%氯氰菊酯乳油2000倍液，或20%灭扫利3000倍液等喷雾药杀成虫。
3、药剂防治。田间发现有根蛆为害时，可用1.8%阿维菌素3000倍液，或75%灭蝇胺可湿性粉剂5000倍液或48%辛·蜱乳油(地蛆灵)2000倍液等，沿蔬菜的根部进行浇灌。每隔7~10天1次，连续2~3次，杀灭根部的幼虫。