胡萝卜黑斑病的病原以菌丝或孢子在病残株和种子内外越夏或越冬。孢子在土表可存活一年，但在水中1个月即死亡。病菌主要以菌丝体和分生孢子在玉米杆等病残体越冬，成为翌年初侵染源。该病常在温暖湿润和雾日较多的地区发生；连年大面积种植感病品种，是翌年该病发生的重要条件。玉米灰斑病是一个空气传播的病害。分生孢子从植株的下部向上部传播，然后在株间传播。该病一般在6月中下旬开始发病，下部叶先发病；7月缓慢发展，危害到中部叶片；8月上中旬发病加快，危害加重；8月下旬至9月上旬，由于高温高湿天气，容易迅速爆发扩大；甚至在短时间内能使整株的叶片干枯，形成农民俗称的“秋风病”。