牛羊口蹄疫的首要症状是发热。患病的牛羊往往会出现体温升高，超过正常范围，这是由于病毒感染引起的免疫反应所致。体温的升高可能伴随其他症状，如食欲不振和乏力。
牛羊口蹄疫会引起口蹄部的炎症。患病的动物可能会出现口腔溃疡、唇舌疱疹、蹄间疱疹等症状。这些病征往往伴随着疼痛和不适感，使得动物进食和行走变得困难。
此外，牛羊口蹄疫还会导致蹄部症状。受感染的动物往往会出现蹄内外侧壁溃疡、蹄间皮肤破损、蹄蹄底溃疡等。这些病征会导致牛羊行走时出现跛行，甚至无法正常站立，严重影响它们的生活质量。
患病动物还可能出现泌乳量下降、呼吸困难、眼部炎症等其他系统症状。