在种植中应实施轮作，并合理密植，保持良好的通风透光，雨后及时排水。发病初期及时使用农用链霉素或新植霉素进行喷施，可交替用药加强效果。辣椒很容易受到棉铃虫、蚜虫等害虫的啃咬，而这也是辣椒表皮出现伤口的主要原因。所以辣椒软腐病的首要防治措施，就是要对辣椒进行虫害防治，将虫子啃食辣椒的伤害降到最低。首先通过人为措施将虫子消灭掉，然后后期可用生菌素、多菌康进行控制。软腐病对辣椒质量损害较大，会降低商品价值。不宜重茬种植，不宜密度过大，不宜以氮肥为主。①实行与非茄科及十字花科蔬菜进行2年以上轮作。②及时清洁田园，尤其要把病果清除带出田外烧毁或深埋。③培育壮苗，适时定植，合理密植。雨季及时排水，尤其下水处不要积水。④保护地栽培要加强放风，防止棚内湿度过高。