番茄发病时，根及根茎部产生褐斑，逐渐扩大凹陷，严重时病斑绕茎基部或根部一周，纵切根部及根茎部，导管变成褐色，腐烂，不长新根，植株萎蔫而死。植株新叶在晴天中午萎蔫，早、晚能恢复。横切病茎，变褐的导管手挤不出菌脓，此点可与细菌性青枯病相区别。番茄根腐病病原为墨色刺盘孢，属半知菌亚门真菌。分生孢子具有隔膜，呈现为墨褐色，刚毛较多，大小约为200～350微米，主要盘生在直径长度约为0.5毫米的菌核上。分生孢子形状为梗圆筒形，稍弯或分枝。该病菌除了为害番茄，同时还为害马铃薯、茄子等茄科作物。
