番茄发病根及根茎部产生褐斑，逐渐扩大凹陷，严重的病斑绕茎基部或根部1周，纵切根部及根茎部，导管变成褐色，腐烂，不长新根，植株萎蔫而死。植株新叶在晴天中午萎蔫，早、晚能恢复。横切病茎，变褐的导管手挤不出菌脓，此点，可与细菌性青枯病相区别。
番茄根腐病病原形态特征是根茎部产生褐斑，腐烂，不长新根，植株萎蔫而死。
番茄根腐病病原为墨色刺盘孢，属半知菌亚门真菌。分生孢子具有隔膜，呈现为墨褐色，刚毛比较多。大小约为200～350微米，主要盘生在直径长度约为0.5毫米的菌核上。且分生孢子的形状为梗圆筒形，稍弯或分枝。该病菌除了为害番茄，同时还为害马铃薯、茄子等茄科作物。
（以上内容为农技人员个人观点，仅供参考）