根腐病主要危害幼苗，成株期也能发病。发病初期，仅仅是个别支根和须根感病，并逐渐向主根扩展，主根感病后，早期植株不表现症状，后随着根部腐烂程度的加剧，吸收水分和养分的功能逐渐减弱，地上部分因养分供不应求，新叶首先发黄，在中午前后光照强、蒸发量大时，植株上部叶片才出现萎蔫，但夜间又能恢复。病情严重时，萎蔫状况夜间也不能再恢复，整株叶片发黄、枯萎。此时，根皮变褐，并与髓部分离，最后全株死亡。
根腐病分为疫霉根腐病和腐霉根腐病两种。疫霉根腐病发病初期于茎基或根部产生褐斑，逐渐扩大后凹陷，严重时病斑绕茎基部或根部一周，致地上部逐渐枯萎；纵剖茎基或根部，导管变为深褐色，后根茎腐烂，不长新根，植株枯萎而死。腐霉根腐病的主要症状是植株茎基部在土表上下2-3公分处出现水渍状暗绿色病斑，根系的须根和次生根出现水渍状淡褐色腐烂，不长新根，随后发展到主根和根茎处，出现淡褐色表皮，纵剖根茎维管束为浅褐色至褐色病变，表皮腐烂后容易脱落。二者的主要区别是根部表皮是否脱落。
根腐病的症状还包括叶片萎缩，根部有肿瘤，腐烂病情严重全株死亡。主要危害茎基部，叶、茎、根均可受害。出土幼苗有的心叶腐烂，有的茎基变褐、缢缩，引起摔倒，造成缺苗断垄。