大葱白腐病的病株叶片从顶尖开始向下变黄，进而矮化枯死。茎基部组织先变软，后干腐，微凹陷，灰黑色，可沿茎基部向上扩展，地上部分变黑腐败。湿度大时，叶鞘表面、葱头和不定根上长出许多绒毛状白色菌丝体，后菌丝减退而露出黑色球形小菌核。菌核多时，重叠成块，贮藏期鳞茎可继续腐烂。受害植株叶尖变黄，植株矮化枯死，茎基部组织变软，以后呈干腐状，微凹陷，灰黑色，并沿茎基部向上扩展，地下部变黑腐败。叶鞘表面或组织内生有稠密的白色绒状霉，逐渐变成灰黑色，并迅速形成大量菌核。菌核圆形较小，大小为0.5-1毫米，常彼此重叠成菌核块，菌核块厚度有时可达5毫米左右。