防治辣椒青枯病可采取以下措施：
农业防治：
1.实行轮作。有计划地轮作，能有效降低土壤含菌量，减轻病害发生。
2.改良土壤。
3.优化栽培方式。采用高垄或半高垄栽培方式，配套田间沟系，降低田间湿度，同时增施磷、钙、钾肥料，促进作物生长健壮，抗病能力提高，能减轻青枯病发生。
4.培育壮苗。采用营养钵、肥团、温床育苗，培育矮壮苗，以增强作物抗病、耐病能力。
5.喷施微肥。喷施微肥可促进植株维管束生长发育，提高植株抗耐病能力。
药剂防治：
预防方案：专业植物疫苗进行灌根、冲施、叶面喷洒，7—10天灌1次，连灌2-3次。具体详见产品说明书。发病后及时拔除病株，相邻植株均撒上石灰防止病情蔓延。防止水流传带病菌。发病期要预防性喷药，用芭盾将军铜制剂复配甲霜.恶霉灵兑水15kg稀释，全株喷施，连续喷施2-3次，间隔期7-10天。
其他措施：
1.合理轮作：前茬以十字花科和豆科作物以及葱、蒜等蔬菜为宜，尽量避免与茄果类、瓜类等蔬菜连作，以有效阻断发病源。
2.选用抗病品种。
3.进行种子消毒。
4.及时拔除病株，并在病穴上撒少许石灰消毒杀菌等。